Dies ergab die Auslosung am Dienstag in Wien.
Die Hinspiele sollen am 18./19. November ausgetragen werden, die Rückspiele eine Woche später. Magdeburg und Göppingen haben zunächst Heimrecht, Berlin beginnt mit einem Auswärtsspiel in der portugiesischen Hafenstadt.
Die jeweiligen Gewinner erreichen die Gruppenphase, die am 10. Februar 2018 starten wird. In den vergangenen drei Jahren kam der Sieger des EHF-Cups wie in 13 der letzten 14 Spielzeiten stets aus der Bundesliga.