Durch seinen Erfolg übernahm Thomas auch die Gesamtführung, mit 33 Sekunden Rückstand bester Deutscher im Klassement ist Zeitfahrspezialist Tony Martin (Cottbus/Etixx-Quick Step) als Achter.
Der 29-Jährige hat am Freitag eine gute Möglichkeit, beim 19 km langen Einzelzeitfahren von Vila do Bispo nach Sagres den Rückstand zu verkürzen.